Antonio Barbadilla Prados

Personal information

Email: antonio.barbadilla@uab.es

Unit: Genomics in Evolution and Disease

Group: Bioinformàtica de la Diversitat Genòmica

Category: Professor Titular

Lab phone: 935868941

Academic information and publications


I am a Professor and Researcher at the Department of Genetics and Microbiology and the Institute of Biotechnology and Biomedicine of the University Autònoma of Barcelona (UAB). I obtained my PhD in 1992 studying natural selection acting on chromosome rearrangements in wild populations of Drosophila. As Postdoctoral researcher I worked at Harvard University with Prof. Richard C. Lewontin, specializing in Population Genetics and Molecular Evolution. From my first contact with the concept of natural selection,  I have continuously been investigating the ramifications, always fascinating, of that "view of life" that Darwin invited us to discover.

My research field is Population Genetics. At present, I am research leader of the Bioinformatics of Genomic Diversity group, funded regularly by the Spanish Science Research Agency. The representation, analysis and interpretation of DNA variation and its relationship with phenotypic variation is the focus of my research (SNPs and QTLs). One of the most amazing examples of the power of natural selection is the distinctive footprint it leaves on patterns of genetic variation. Using theoretical models of population genetics and statistical methods, we analyze and interpret genetic variation at the genomic scale. Likewise, we develop bioinformatics tools for cataloging and representing genetic diversity in a growing number of species, including humans. Our research has been published in more than fifty scientific papers, the majority in recognized international journals as Nature, Science, Nature Communications, Genome Research, Molecular Biology and Evolution, Genetics, Nucleic Acids Research, etc., and more than two hundred talks and communications at national and international conferences. Among other recent achievements, the group has: (i) charted the first high resolution map of natural selection along a genome, (ii) mapped natural selection over the complete anatomy of an embryo, (iii) quantified the evolutionary cost of linkage in a genome, (iv) identified more than 800 new regions of the human genome as firm candidates of being subject to natural selection, and (V) shown that germline de novo mutation rates on exons versus introns do not differ in humans. As resources to facilitate the investigation of genomic variability, large inventories of genetic diversity measures and catalogue of putative regions under selection along the human and Drosophila genomes have been made available to the scientific community.

At the present research, we follow an interdisciplinary approach, merging methods and knowhow from genomics, population genetics, system biology and bioinformatics, to address the following objectives: (1) Integrate population genomics data with functional data to characterize the genomic determinants of nucleotide and protein evolution; (2) Develop new theoretical population genetics models to estimate the action of selection on genome variation; (3) Analyze adaptive evolution and conservation of developmental genes which are differentially expressed in time and space for Drosophila and humans. 

Our research is an independent line of the Genomics, Bioinformatics and Biological Evolution group, recognized and funded by the Generalitat de Catalunya (2021 SGR 00526).

In addtion to my research, I am passionate about teaching and communicating science, which I consider of the greatest relevance to improve the scientific knowledge of society. I feel fortunated of teaching to exquisite, motivated students, the spectacular and exciting advances that are taking place in genomics and bioinformatics. From this vocational background arises my commitment for teaching quality and innovation in higher education. I have led the implementation of innovative studies such as the Genetics degree and the strategic Master of Bioinformatics, both at the UAB. As an ICT resource to support face-to-face teaching, we designed and implemented a pioner Web 2.0 platform for university teaching. 

Being aware of the need of public understanding of science, I promote activities spreading the advances in Genomics, Bioinformatics and Evolution, organizing scientific meetings and courses, giving conferences, writing essays, organizing exhibitions, creating Web and multimedia resources. 

Convinced also on the importance of the transference of scientific knowledge to the technological and productive fabric of society, I have also launched entrepreneurial initiatives and set bioinformatics platforms up to support Omics research.  

I have participated in 31 regional, national, European and international projects (18 scientific, 4 technological, 3 of science dissemination and 6 teaching innovation and implementation of new degrees) and in 14 of them I have been PI.

I have supervised ten doctoral theses (and currently two) and 23 master's thesis. I am regular reviewer of international journals in the field of Population Genetics, Bioinformatics and Evolution and evaluator of research and academic projects of international, national and regional research agencies. 








































Líneas de Investigación / Research Lines

    • Genómica y multiómica de poblaciones / Population genomics and population multiomics

    • Impacto de la selección ligada en los patrones de variación y la adaptabilidad del genoma / Impact of linked selection on variation patterns and adaptability of the genome 

    • Cartografía de la huella de la selección natural a lo largo del genoma / Mapping the footprint of natural selection through the genome

    • Diseño e implementación de navegadores de diversidad genómica / Design and implementation of genome diversity browsers
    • Representación, análisis e interpretación bioinformática de SNPs y QTLs / Bioinformatic representation, analysis and interpretation of SNPs and QTLs
    • Desarrollo de plataformas bioinformáticas que exploran y analizan la variación genética en grandes bases de datos genómicas y ómicas / Implementation of bioinformatic platforms to explore and analyze genetic variation in big genomics and omics data bases
    • Papel de la conversión génica y del entrecruzamiento en las tasas de recombinación a nivel del DNA / Role of gene conversion and crossing over on the recombination rate at the DNA level
    • Minería de datos en Genética de Poblaciones / Data mining in population genetics

    • Origen de las inversiones cromosómicas / Origin of chromosomal rearrangements

    • Efecto de las inversiones cromosómicas sobre caracteres de la eficacia biológica en Drosophila / Fitness effects of chromosomal rearrangements in Drosophila
    • Selección natural en poblaciones naturales de Drosophila / Natural selection in the wild

    • Aspectos conceptuales e históricos de la teoría neutralista de la evolución molecular / Conceptual and historical issues of Neutral theory of molecular evolution

    • Aspectos conceptuales de la teoría de la selección natural / Conceptual issues of theory of natural selection

    • Difusión de la genética y evolución en la sociedad / Promoting Public Understanding of Genetics and Evolution


Proyectos financiados / Funded projects 

Científicos / Scientific Research 

    • 2022-2024: Genómica de poblaciones de la adaptación. Investigadores: Antonio Barbadilla (IP1), Jaime Martínez-Urtaza (IP2), Mauro Santos, Antonio Fontdevila, Pilar García-Guerreiro, Sònia Casillas, Raquel Egea, Andrés Santos, Jesús Murga, Aina Colomer, Ruth Gómez.  MICINN PID2021-127107NB-I00. (En ejecución).
    • 2023-2028: PopLife: the reference online population genomics browser across the tree of life. Antonio Barbadilla (IP), Sònia Casillas. RES - Red Española de Supercomputación, DATA-2022-1-0015. (En ejecución).
    • 2021-2024: Genómica, Bioinformática y Biología Evolutiva. Grup recerca consolidat de la Generalitat de Catalunya2021 SGR 00526. Mauro Santos (IP), Antonio Barbadilla, Mario Cáceres, Sònia Casillas, Pilar García, Jaime Martínez-Urtaza, Isaac Salazar.  (En ejecución). 
    • 2021-2025: PLASTICHEAL: Innovative tools to study the impact and mode of action of micro and nanoplastics on human health: towards a knowledge base for risk assessment. Marcos Dauder (IP), R., Barbadilla Prados, A., Buffa Dunat, M. N., Casillas Viladerrams, S., Hernandez Bonilla (IP), A., Juan Godoy, B., Pastor Benito, S., Perez Gonzalez, G., Valiente Malmagro, M. & Velazquez Henar, M. A. Funded under H2020-EU.3.1 / H2020-EU.3.1.1. (En ejecución). 
    • 2018-2021: Genómica poblacional de la adaptación. Investigadores: Mauro Santos (IP1) y Antonio Barbadilla (IP2),  Alfredo Ruiz, Antonio Fontdevila, Pilar García-Guerreiro, Francisco Rodríguez-Trelles, Sònia Casillas, Raquel Egea, Marta Coronado, Sergi Hervàs, Jesús Murga.  MINECO CGL2017-89160-P.  
    • 2018-2021: Genómica, Bioinformática y Biología Evolutiva. Grup recerca consolidat de la Generalitat de Catalunya (2017SGR 1379. Alfredo Ruiz (IP), Mauro Santos, Antonio Barbadilla, Mario Cáceres, Isaac Salazar.  
    • 2014-2017: La interpretación de la variación genómica desde la secuencia nucleotídica al fenotipo en Drosophila y humanos. Investigadores: Antonio Barbadilla (IP1), Mario Cáceres (IP2), Isaac Salazar, Sònia Casillas, Marta Puig, Raquel Egea, Carla Giner, Marta Coronado, Sergi Hervàs, Isaac Noguera, Ion Lerga.  MINECO BFU2013-42649-P. 
    • 2014-2016: Genómica, Bioinformática y Biología Evolutiva. Grup recerca consolidat de la Generalitat de Catalunya (2014SGR 1346). Alfredo Ruiz (IP), Mauro Santos, Antonio Barbadilla, Mario Cáceres, Isaac Salazar.
    • 2010-2013: Análisis genómico del polimorfismo y la divergencia en Drosophila melanogaster.  Investigadores: Antonio Barbadilla (IP), Sònia Casillas, Esther Betrán, David Castellano, Miquel Ràmia, Maite Barrón.  MICINN BFU2009-09504/BMC. 

    • 2009-2013: Genómica, bioinformática y evolución. Grup recerca consolidat de la Generalitat de Catalunya (2009SGR 88). Alfredo Ruiz (IP), Antonio Barbadilla, Roger Vila e Isaac Salazar. 

    • 2008-2012: Drosophila Genetic Reference Panel: A Community Resource for the Study of Genotypic and Phenotypic Variation. IPs: Trudy Mackay, Stephen  Richards and Richard Gibbs. IP Partner UAB: Antonio Barbadilla. 
      http://flybase.org/static_pages/news/whitepapers/Drosophila_Genetic Reference Panel_Whitepaper.pdf

    • 2007-2009: Patterns of nucleotide diversity in different functional regions of Drosophila and Chordates. Investigadores: Antonio Barbadilla (IP), Sònia Casillas, Natalia Petit, Raquel Egea, Esther Betrán. MEC BFU2006-08640/BMC. 

    • 2005-2008: Association studies assisted by Inference and Semantic Technologies (ASSIST). Project Coordinator: P. Mitkas (CERHT/ITI). Sixth Framework Programme. STRP: Integrated biomedical information for better health. FP6-IST-2004-027510. IP Partner UAB: Antonio Barbadilla 

    • 2005: Identificación de genes implicados en la susceptibilidad de padecer fibromialgia y/o síndrome de fatiga crónica. Similitudes y diferencias genéticas. Fundación para la Fibromialgia y el Síndrome de Fatiga Crónica, Fundación Echevarne, ebiointel, Dpt Genètica i Microbiologia UAB, CEGEN, bancoADN. 

    • 2003-2005: Genómica comparada y funcional de Drosophila: causas y consecuencias de las reordenaciones cromosómicas naturales. Investigadores: A. Ruiz (IP), A. Barbadilla, Josefa González, Ferran Casal, Bárbara Negre, Marta Puig, Cristina Santa, Sònia Casillas. MCYT - BMC2002-01708. 2003-2005. 

    • 1999-2002: Proyecto: Distribución de las tasas de recombinación local causadas por conversión y entrecruzamiento a lo largo del genoma. Investigadores: A. Barbadilla (IP); A. Navarro y Cristina Santa. DGICYT - PB98-0900-C02-02. 1999-2002. 

    • 1996-1998: Origen y evolución molecular de las inversiones cromosómicas de Drosophila buzzatii. Investigadores: A. Ruiz (IP); A. Barbadilla; E. Betrán; A. Navarro; José María Ranz; Mario Cáceres; Josefa González. DGICYT -PB95-0607. 

    • 1994-1996: Significado adaptativo del polimorfismo cromosómico. Investigadores: A. Ruiz (IP); A. Barbadilla; E. Betrán; A. Navarro. DGICYT - PB93-0844. 

    • 1990-1993: Biología evolutiva de poblaciones originales y colonizadoras de especies cactòfilas de Drosophila. A. Fontdevila (IP), A. Barbadilla, A. Ruiz, A. Santos. CICYT PB89-0325


Tecnológicos / Technological

    • 2023-25: PopLife: the reference online population genomics browser across the tree of life. Asignación de recursos de datos para la Red Española de Supercomputación (RES). Convocatoria de datos 2023. Investigadores: A. Barbadilla (IP); S. Casillas.

    • 2006-2012: Proyecto Plataforma Bioinformàtica UAB-Institutos Investigación de Hospitales / Bioinformatic Platform UAB-Hospital Research Institutes. A. Barbadilla (IP), S. Casillas, Àlex Sànchez, José Manuel Soria. Vicerectorat Projectes Estratègics UAB, 2006-12. 

    • 2004-2005: Proyecto Neotec/La Caixa para la ejecución del proyecto ebioPlatform: / Neotec/La Caixa project for the developing of ebioPlatform. I. Durán, A. Barbadilla, B. Aranda, J. Puiggene, J. Colomer, N. Arroyo. Ministerio de Industria, 2004-05. 

    • 2002: Gestión del desarrollo de herramientas bionformáticas / Management for the development of bioinformatic tools. Investigador Principal (IP): A. Barbadilla. Convenio colaboración Fundación Empresa y Ciencia, UAB, 2002. 

    • 2001-2002: Proyecto del Centro de Innovación y Desarrollo Empresarial (CIDEM) para la creación de una empresa de base tecnológica / CIDEM project for the development of a technological based company. Investigador Principal (IP): A. Barbadilla. 2001-02. 


Difusión de la ciencia / Communicating Science

    • Genética y Genómica: una invitación a la genética. Proyecto de acciones especiales de difusión de la Ciencia y la Tecnología. Ministerio Ciencia y Tecnología. / Special action project for public communication of science. Investigadores: A. Barbadilla (Investigador Principal); C. Santa. AE00-0128-DIF. 2001-02. 


Docentes / Teaching

    • 2019-2022 Adapta't. Proyecto de mejora de la calidad docente subvencionado por el vicerectorado de Programación Académica y de Calidad de la UAB. Profesores: Sònia Casillas (IP), Gemma Armengol, Antonio Barbadilla, Aina Colomer, Marta Coronado, Raquel Egea, Pilar García, Ruth Gómez, Jesús Murga, Alicia Roque. 

    • 2011-2012: Coordinador Propuesta e implantación Máster estratégico de bioinformática de la UAB. Acción estratégica del proyecto UAB - Campus de Excelencia. (2011-2012)

    • 2007-2009: Coordinador Propuesta e implantación Grado Genética de la UAB. Facultat de Biociències. (2007-2009). 

    • 2002-2019: Diseño e implementación una plataforma Web 2.0 para la docencia universitaria (actualización anual). Servei de Genòmica i Bioinformàtica (2002-2019). Diseñado e implementado por Antonio Barbadilla. 

    • 2007-2008: Aula permanent de genètica. Ajuts projectes d'innovació docent 2007. Vicerectorat d'Estudis i de Qualitat, UAB. 2007-2008. Antonio Barbadilla (IP), Miquel Ràmia, Maite Barrón, Santiago Pastor, Ricard Marcos, Amadeu Creus, Antonia Velázquez. 

    • 2004-2006: Implementación de herramientas multimedia en toda una Titulación: el caso de Biología en la UAB / Implementing multimedia tools in the College: the case of Biology at the UAB. (Conjuntamente con la comisión de docencia de Biología: Antonio Barbadilla, Javier Retana, Amalia Molinero, Marina Luquín, Miquel Ninyerola y Elena Ibáñez). Proyectos de mejora de la calidad docente AGAUR 2004MQD 00068. 2004-06.  



Artículos en revistas de investigación acreditadas (JCR- Factor de impacto) / Articles in International Science Journals (JCR)

  • Jesús Murga-Moreno, Sònia Casillas, Antonio Barbadilla, Lawrence Uricchio, David Enard, An efficient and robust ABC approach to infer the rate and strength of adaptation, G3 Genes|Genomes|Genetics, Volume 14, Issue 4, April 2024, jkae031, https://doi.org/10.1093/g3journal/jkae031
  • Jesús Murga-Moreno, Marta Coronado-Zamora, Sònia Casillas, Antonio Barbadilla. 2022. The Imputed McDonald and Kreitman test (impMKT): a straightforward correction that significantly increases the evidence of positive selection of gene-by-gene MKT analyses, G3 Genes|Genomes|Genetics, 2022;, jkac206, https://doi.org/10.1093/g3journal/jkac206
  • Aina Colomer-Vilaplana, Jesús Murga-Moreno, Aleix Canalda-Baltrons, Clara Inserte, Daniel Soto, Marta Coronado-Zamora, Antonio Barbadilla, Sònia Casillas 2022. PopHumanVar: an interactive application for the functional characterization and prioritization of adaptive genomic variants in humans, Nucleic Acids Research, Volume 50, Issue D1, 7 January 2022, Pages D1069–D1076, https://doi.org/10.1093/nar/gkab925

  • Kapun, M. et al. 2021. Drosophila Evolution over Space and Time (DEST): A New Population Genomics Resource. Molecular Biology and Evolution, 2021;, msab259, https://doi.org/10.1093/molbev/msab259
  • Rodriguez-Galindo, M., Casillas, S., Weghorn, D. and Barbadilla, A. 2020. Germline de novo mutation rates on exons versus introns in humansNat Commun 11, 3304 (2020). https://doi.org/10.1038/s41467-020-17162-z

  • Murga-Moreno, J.; Coronado-Zamora, M.; Hervás, S.; Casillas, S & A. Barbadilla 2019. iMKT: the integrative McDonald and Kreitman test. Nucleic Acids Research https://doi.org/10.1093/nar/gkz372

  • Coronado*, M, I. Salvador*, D. Castellano, A. Barbadilla & I. Salazar. 2019. Adaptation and conservation throughout the Drosophila melanogaster life-cycle. Genome, Biology and Evolution evz086, https://doi.org/10.1093/gbe/evz086.

  • Murga-Moreno, J.; Coronado-Zamora, M.; Bodelón, A.; Barbadilla, A. and Casillas, S  2019. PopHumanScan: the online catalog of human genome adaptation. Nucleic Acids Research, gky959, https://doi.org/10.1093/nar/gky959 

  • Casillas*, S., R. Mulet*, P. Villegas-Mirón, S. Hervás, E. Sanz, D. Velasco, J. Bertranpetit, H. Laayouni & A. Barbadilla. 2018. PopHuman: the human population genomics browser. Nucl. Acids Res. gkx943, https://doi.org/10.1093/nar/gkx943    *Equal contribution.  

  • Salvador*, I., M. Coronado*, D. Castellano, A. Barbadilla & I. Salazar. 2018. Mapping selection within Drosophila melanogaster embryo’s anatomy. Molecular Biology and Evolution https://doi.org/10.1093/molbev/msx266.
    * Equal contribution. 

  • S. Hervas, E. Sanz, S. Casillas, J. Pool and A. Barbadilla. 2017. PopFly: the Drosophila population genomics browser. Bioinformatics https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btx301

  • Casillas, S. and A. Barbadilla. 2017. Molecular Population Genetics. Genetics 205: 1003–1035https://doi.org/10.1534/genetics.116.196493
  • Pavlidou, P.; A. Daponte, R. Egea, E. Dardiotis, G.M. Hadjigeorgiou, A. Barbadilla & T. Agorastos. 2016. Genetic polymorphisms of FAS and EVER genes in a Greek population and their susceptibility to cervical cancer: a case control study. BMC Cancer 2016 16:923.

  • Castellano, D., M. Coronado-Zamora, JL. Campos, A. Barbadilla, A. Eyre-Walker. 2016. Adaptive evolution is substantially impeded by Hill-Robertson interference in Drosophila. Mol Biol Evol (2016) 33 (2): 442-455.

  • Guillén, Y. et al. 2015. Genomics of ecological adaptation in cactophilic Drosophila. Genome Biol Evol (2015) (1):349-366.doi: 10.1093/gbe/evu291.

  • Huang, W. et al. 2014. Natural Variation in Genome Architecture. Among 205 Drosophila melanogaster Genetic Reference Panel Lines. Genome Research 2014. 24:1193-120.

  • A. Martínez-Fundichely, S. Casillas, R. Egea, M. Ràmia, A. Barbadilla, L. Pantano, M. Puig & M. Cáceres. 2014. InvFEST, a database integrating information of polymorphic inversions in the human genome. Nucl. Acids Res.42 (D1): D1027-D1032.doi: 10.1093/nar/gkt1122.

  • Gutiérrez F,M Gárriz,JM. Peri, L Ferraz,D Sol, JB Navarro, A Barbadilla, M Valdés. 2013. Fitness costs and benefits of personality disorder traits. Evolution and Human BehaviorFitness costs and benefits of personality disorder traits. Evolution and Human Behavior. Volume 34, Issue 1, January 2013, Pages 41–48.

  • T.F.C. Mackay*, S. Richards*, E.A. Stone*, A. Barbadilla*, ..., S. Casillas, M. Barrón, D. Castellano, P. Librado, M. Ràmia, J. Rozas et al. 2012. The Drosophila melanogaster Genetic Reference Panel: A Community Resource for Analysis of Population Genomics and Quantitative Traits. Nature 482: 173-178.
    * Equal contribution. 

  • Ràmia M, Librado P, Casillas S, Rozas, J & Barbadilla A. 2012. PopDrowser: The Population Drosophila Browser. Bioinformatics Feb 15;28(4):595-6.  

  • Miquel M, López-Ribera I, Ràmia M, Casillas S, Barbadilla A, Vicient CM. 2011. MASISH: a database for gene expression in maize seeds. Bioinformatics 27(3):435-436
  • Petit, N. and A. Barbadilla (2009). The efficiency of purifying selection in Mammals vs Drosophila metabolic genes. J. Evol. Biology 22: 2118-2124.

  • Petit, N. and A. Barbadilla (2009). Selection efficiency and effective population size in Drosophila species. J. Evol. Biology 22: 515-526. 

  • Egea, R., S. Casillas and A. Barbadilla (2008). Standard & Generalized McDonald and Kreitman test: a website to detect selection by comparing different classes of DNA sites. Nucleic Acids Res2008 July 1; 36 (Web Server issue): W157–W162.

  • Casillas, S., R. Egea, N. Petit, C. Bergman and A. Barbadilla (2007). Drosophila Polymorhism Database (DPDB): a portal for nucleotide polymorphism in Drosophila. Fly (4): 205-211.

  • Casillas, S., A. Barbadilla and C. Bergman (2007). Purifying selection maintains highly conserved noncoding sequences in Drosophila. Mol Biol Evol doi:10.1093/molbev/msm150.

  • Petit, N., S Casillas, A. Ruiz and A. Barbadilla  (2007). Protein polymorphism is negatively correlated with conservation of intronic sequences and complexity of expression patterns in Drosophila melanogaster. Journal of Molecular Evolution 64: 511-518.  

  • Egea, R, S. Casillas, E. Fernández, MA Senar & A. Barbadilla (2007). MamPol: a database of nucleotide polymorphism in the Mammalia class. Nucleic Acids Res2007 January; 35(Database issue): D624–D629 

  • Casillas, S, B Negre, A Barbadilla and A Ruiz (2006). Fast sequence evolution of Hox and Hox-derived genes in the genus Drosophila. BMC Evolutionary Biology 2006, 6:106.  

  • Casillas, S & A. Barbadilla (2006). PDA v.2: improving the exploration and estimation of nucleotide polymorphism in large data sets of heterogeneous DNA. Nucl. Acids Res2006 34: W632-W634

  • Casillas, S, N. Petit & A. Barbadilla (2005). DPDB: a database for the storage, representation and analysis of polymorphism in the Drosophila genus. Bioinformatics 2005 21: ii26-ii30; doi:10.1093/bioinformatics/bti1103 

  • Bárbara Negre, Sònia Casillas, Magali Suzanne, Ernesto Sánchez-Herrero, Michael Akam, Michael Nefedov, Antonio Barbadilla, Pieter de Jong and Alfredo Ruiz (2005). Conservation of regulatory sequences and gene expression patterns in the disintegrating Drosophila Hox gene complex. Genome Research 15: 692-700, 2005 

  • Casillas, S & A. Barbadilla (2004). PDA: a pipeline to explore and estimate polymorphism in large DNA databases. Nucleic Acid Research, Web Server issue 32: W166-W169

  • Casillas, S., N Petit, R Egea, A Barbadilla. 2004. Storage, Representation and Analysis of Nucleotide Polymorphism. Spanish Bioinformatics Conference137-141

  • Navarro, A. Barbadilla & A. Ruiz. (2000). Effect of inversion polymorphism on the neutral nucleotide variability of linked chromosomal regions. Genetics 155: 685-698

  • Cáceres, M., J.M. Ranz, A. Barbadilla, M. Long & A. Ruiz. (1999). Generation of a widespread Drosophila inversion by a transposable element, Science 285: 415-418

  • Cáceres, M., A. Barbadilla & A. Ruiz. (1999). Recombination rate predicts inversion size in Diptera», Genetics 153: 251-259

  • Cáceres, M., A. Barbadilla & A. Ruiz. (1997). Inversion length and breakpoint distribution in the Drosophila buzzatii species complex: Is inversion length a selected trait?, Evolution 51: 1149-1155

  • Betrán, E., J. Rozas, A. Navarro & A. Barbadilla. (1997). The estimation of the number and the distribution of gene conversion tracts from population DNA data», Genetics 146: 89-99

  • Navarro, A., E. Betrán, A. Barbadilla & A. Ruiz. (1997). Recombination and gene flux caused by crossing over and gene conversion in inversion heterokaryotypes. Genetics 145: 281-295.

  • Ruiz A., J.M., Ranz, M. Caceres,  C. Segarra, A. Navarro & A. Barbadilla. (1997). Chromosomal evolution and comparative gene mapping in the Drosophila repleta species group. Genetics and Mol. Biol. 20: 553-565.

  • Barbadilla A, King LM, Lewontin RC. What does electrophoretic variation tell us about protein variation? Mol Biol Evol. 1996 Feb;13(2):427-32  

  • Ruiz, A. y A. Barbadilla. (1995). The contribution of quantitative trait loci and neutral marker loci to the genetic variances and covariances among quantitative traits in random mating populations», Genetics 139: 445-455

  • Barbadilla, A. Ruiz, M. Santos & A. Fontdevila. (1994). Mating pattern and fitness component analysis associated with inversion polymorphism in a natural population of Drosophila buzzatii, Evolution 48: 767-780

  • Naveira, H, & A. Barbadilla. (1992). The theoretical distribution of lengths of intact chromosome segments around a locus held heterozygous with backcrossing in a diploid species, Genetics 130: 205-209

  • Barbadilla, A., H. Naveira, A. Ruiz & M. Santos. (1992).  The estimation of genotypic probabilities in an adult population by the analysis of descendants, Genetical Research 59: 131/137.  

  • Santos, M., A. Ruiz, J. E. Quezada Díaz, A. Barbadilla and A. Fontdevila. 1992. The evolutionary history of Drosophila buzzatii. XX. Positive phenotypic covariance between field adult fitness components and body size. Journal of Evolutionary Biology 5:403-422. 

  • Ruiz, A., M. Santos, A. Barbadilla, J. E. Quezada-Díaz, E. Hasson & A. Fontdevila. (1991). Genetic variance for body size in a natural population of Drosophila buzzatii, Genetics 128: 739-750

  • Barbadilla, A. 1991. State of art of the problematic of higher taxa. Ameghiniana 28:295-301.

  • Barbadilla, A., J. E. Quezada Díaz, A. Ruiz, M. Santos and A. Fontdevila. 1991. The evolutionary history of Drosophila buzzatii. XVII. Double mating and sperm predominance. Genetics Selection Evolution 23:133 140.  

  • Santos, M., A. Ruiz, A. Barbadilla, J. E. Quezada Díaz, E. Hasson and A. Fontdevila. 1988. The evolutionary history of Drosophila buzzatii. XIV. Larger flies mate more often in nature. Heredity 61:255 262. 

  • Barbadilla, A. & H. Naveira. (1988). «The estimation of parental genotypes by the analysis of a fixed number of their offspring.», Genetics 119: 465-472.

Artículos en libros / Books articles 

  • Berry, A. & A. Barbadilla. (2000). «Gene conversion is a major determinant of genetic diversity at the DNA level», en Evolutionary Genetics from Molecules to Morphology. R. S. Singh y C. B. Krimbras (eds.) Cambridge University Press, NY

  • A. Barbadilla (2009). "Darwinismo y Creacionismo". Cent cinquanta anys després de L’origen de les espècies de Darwin, (A. Navarro y C. Segarra eds.). Treballs de la Societat Catalana de Biologia, 60 (2009) 245-253. Versión castellana aquí

  • A. Barbadilla (2008). "La recerca sobre el genoma humà". Enciclopèdia Catalana.

  • A. Barbadilla. (2003). "La Comunicación Social de la Ciencia e Internet" en La Ciencia es Cultura, págs. 177-180. Coordinador: Manuel Toharia, Edita: Soc. Gestión Museo de las Ciencias Príncipe Felipe de Valencia.

  • A. Barbadilla. (2000). "La selección natural: me replico, luego existo", en Evolución y filogenia de Artrópodos, pág. 605-612. SEA Vol. 26

  • A. Barbadilla. (1990). "La estructura de la Teoría de la Selección Natural", en Temas actuales de Biología Evolutiva, en A. Ruiz y M. Santos (Coordinadores), págs. 163-191. Publicaciones UAB, Barcelona.

Ensayos y artículos de Divulgación / Popular Science 


Web servers y bases de datos de diversidad genética / Bioinformatic databases and Web Servers  

  • Colomer-Vilaplana, A., Murga-Moreno, J., Canalda-Baltrons, A., Inserte, C., Soto, D., Coronado-Zamora, M., Barbadilla, A. and Casillas S. 2021. PopHumanVar: An Interactive Application for the Functional Characterization and Prioritization of Adaptive Genomic Variants in Humans. https://pophumanvar.uab.cat/

  • Murga-Moreno, J.; Coronado-Zamora, M.; Hervás, S.; Casillas, S & A. Barbadilla 2019. iMKT: the integrative McDonald and Kreitman test. URL: https://imkt.uab.cat/

  • Murga-Moreno, J.; Coronado-Zamora, M.; Bodelón, A.; Barbadilla, A. and Casillas, S. 2018. PopHumanScan: the online catalog of human genome adaptation. URL: http://pophumanscan.uab.cat

  • Casillas, S., R. Mulet, P. Villegas-Mirón, S. Hervás, E. Sanz, D. Velasco, J. Bertranpetit, H. Laayouni & A. Barbadilla. 2018. PopHuman: the human population genomics browser. URL: http://pophuman.uab.cat

  • PopFly: the Drosophila population genomics browser. S. Hervas, E. Sanz, S. Casillas, J. Pool and A. Barbadilla. 2017. URL: http://popfly.uab.cat 

  • PopDrowser: The Population Drosophila Browser. Ràmia M, Librado P, Casillas S, Rozas, J & Barbadilla A. 2012. URL: http://popdrowser.uab.cat

  • Standard & Generalized McDonald and Kreitman test: a website to detect selection by comparing different classes of DNA sites. Egea, R., S. Casillas and A. Barbadilla. 2008. URL: http://mkt.uab.cat 

  • PDA: pipeline para explorar y estimar el polimorfismo de grandes bases de DNA / PDA: a pipeline to explore and estimate polymorphism in large DNA databases - Casillas, S. & A. Barbadilla. 2004. PDA: Pipeline Diversity Analysis. Casillas, S. & A. Barbadilla. 2006. PDA v.2: improving the exploration and estimation of nucleotide polymorphism in large data sets of heterogeneous DNA. URL: http://pda.uab.es
  • MamPol: Mammalia Polymorphism Database. Drosophila Polymorphism Database. Plataforma de representación y análisis de la Diversidad Genética en Mamíferos / MamPol: Mammalia Polymorphism Database. Egea, R, S. Casillas, E. Fernández, MA Senar & A. Barbadilla (2006).  URL: http://mampol.uab.es/ 

  • Plataforma para la representación y análisis de la Diversidad Genética en Drosophila. URL: http://dpdb.uab.es  / DPDB: Drosophila Polymorphism Database. Casillas, S. & A. Barbadilla. 2005. 

Publicaciones en la Web / Internet Publications

  • Cursos / Courses

  • Proyectos multimedia / Multimedia projects

    • Una invitación a la Genética y Genómica (un proyecto multimedia) / An invitation to Genetics and Genomics (a multimedia project). Cristina Santa & Antonio Barbadilla. 2003.

    •  Exposición interactiva: Una invitación a la Bioinformática, una exposición interactiva on line sobre la bioinformática (Abril 2008)

Otros méritos/ Others merits

Estadías en centros extranjeros  

Fulbright Fellow - Investigación Post-Doctoral en Harvard UniversityPopulation Genetics LabsMuseum of Comparative Zoology. Cambridge, EEUU. Duración: 2 años: 1993-94. Tema de investigación: Relación de la variación electroforética y la variación proteica dentro y entre poblaciones.  

Director de la Plataforma Bioinformàtica UAB-Institutos Investigación de Hospitales (2006-12)  

Director científico del Servicio de Genómica y Bionformática de la UAB (2013-2021) 

Co-Director del Multi-Omics Bioinformatics Core Facility (LPS de la UAB) (2021-actualidad) 


Sociedades científicas (es o ha sido miembro) 

Redes científicas (es o ha sido miembro)  

Responsabilidades académicas y de gestión

  • 2000-04: Coordinador adjunto de Docencia de la Licenciatura de Biología, Facultat de Ciències, UAB.
  • 2006-09: Coordinador de la Unidad de Genética del Departamento de Genética y Microbiología, Facultat de Biociències, UAB.
  • 2007-08: Coordinador de la comisión para la propuesta de un nuevo grado de Genética en la UAB
  • 2009-13: Coordinador del grado de Genética en la UAB
  • 2010-12: Coordinador de la comisión para la propuesta de un nuevo máster estratégico de la UAB: Máster en Bioinformática / MSc of Bioinformatics 
  • 2012-19: Coordinador del Máster de Bioinformática de la UAB
  • 2018-20: Coordinador UAB del grado interuniversitario de bioinformática.
  • 2020-24: Coordinador de la Unidad de Genética del Departamento de Genética y Microbiología, Facultat de Biociències, UAB.


Organización de congresos, jornadas científicas, exposiciones, cursos internacionales y ciclos de conferencias


Participación en debates científicos en los medios de comunicación: Participación en debates y entrevistas de Televisión (1234), Radio y Prensa relacionados con los temas de su investigación

Programa Redes: El genoma humano 

Programa Redes: Darwin y la tercera cultura

Investigación del genoma - Programa Tierra de sueños

¿Qué nos permite saber el estudio del ADN? 

Programa Universo Sostenible, La Aventura del Saber (27 abril 2022)

Botón-Rojo: ¿Qué nos permite saber el estudio del ADN?

Tramos de investigación y docencia: Seis tramos de investigación y seis de docencia (máximo número de tramos de investigación y de docencia).

Publicaciones en revistas internaciones (JCR) y capítulos de libro: 54

Presentaciones y comunicaciones en Congresos nacionales e internacionales: 168

Tesis Doctorales dirigidas: 10

Tesis Doctorales que dirige: 2

Trabajos de Master dirigidos: 26 

Miembro de tribunal de Tesis doctoral: 29

Revisor de revistas internacionales del ámbito de la Bioinformática, Genética y Evolución 

  • Miembro del equipo de editores de la revista Animal Biodiversity and Conservation (2001-2009)
  • Revisor Revistas:      
    • Bioinformatics
    • BMC Bioinformatics
    • BMC Evol Bio
    • DNA research
    • Evolution
    • Frontiers in Ecology and Evolution
    • Frontiers in Genetics
    • Genes
    • Genetica
    • Genetical Research
    • Genome Biology
    • Genome Research
    • Genetics
    • Genetics, Selection and Evolution
    • Genome Biology and Evolution
    • Genomics
    • Heredity
    • International Journal of Molecular Sciences
    • Journal of Evolutionary Biology
    • Journal of Molecular Evolution
    • Microbial Cell Factories
    • Molecular Biology and Evolution
    • NAR Genomics & Bioinformatics
    • Scientific Reports

Evaluador de proyectos, ayudas de Investigación Autonómicos, Nacionales e Internacionales y miembro de comités de selección de científicos titulares, técnicos, becarios

  • ERA-Net (European Union's Research and Innovation)
  • ANEP (Agencia Nacional de Evaluación y Prospectiva, España). Proyectos: Generación de Conocimiento, Plan nacional i+d+i, CIBERER, MINECO AEI y ESPDOC, Plan Estatal Excelencia i+d, Explora, ProExt-2012, PEJ-2014, FIS-Proy
  • FECYT (Fundación española para la Ciencia y Tecnología. Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades)
  • AGAUR (Agència de gestió d'Ajust Universitaris i de Recerca, Generalitat de Catalunya)
  • CONICET (Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas, Argentina)
  • CONYCET (Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología, Ciencia de Frontera 2019, México)
  • FONCYT (Fondo para la Investigación Científica y Tecnológica, Argentina)
  • AQU-GenCat (Agència Qualitat - Generalitat de Catalunya)
  • NWO (Netherlands Organisation for Scientific Research, Netherlands)
  • ANR (Agence National de la Recherche, France)
  • SNSF (Swiss National Science Foundation, Switzerland)
  • NNF (Novo Nordisk Fonden - Interdisciplinary synergy programme 2018 - Denmark)
  • UEFISCDI (The Executive Agency for Higher Education, Research, Development and Innovation Funding - Rumania)
  • Proyectos científicos y contratos postdoctorales distintas comunidades autónomas (Madrid, Galicia, Cataluña) 
  • Miembro de comisión evaluadora de concursos de Profesores Titulares universidades españolas 
  • Miembro de comisión evaluadora de concursos de Profesor Agregado universidades catalanas
  • Miembro de comisión evaluadora de concursos de Profesores Titulares universidades argentinas 
  • Selección Científicos Titulares de Organismos Públicos de Investigación (CSIC, España)
  • Evaluador del programa Estatal de Promoción del Talento y su Empleabilidad (Plan Estatal Investigación Científica y Técnica y de Innovación 2013-2016, España)
  • Universidad de Valencia. Concursos de profesor contratado doctor
  • Universitat Autònoma de Barcelona (UAB). Selección personal docente, investigador, técnicos, becarios,...

Iniciativas empresariales

  • 2001-03: Promotor de e-Biointel, una compañía spin-off de Bioinformática del vívero de  empresas del Biocampus, el parque científico y tecnológico de la UAB.

Comunicador Licenciatura Biología 

  • Presentación de las jornadas de Puertas Abiertas de Biología, Fac. Ciencias, 2000-04 (junto con Dr. Javier Retana)
  • Presentación de las jornadas de Puertas Abiertas de Fac Biociències, Fac. Biocièncias, 2017-20 (junto con coordinadores grados biociències)

Traducción obras científicas 

  • Coordinación y supervisión científica de la traducción al español del libro de texto universitario: Genética - Introducción al análisis genético,  Anthony J.F. Griffiths, Susan R. Wessler, Richard C. Lewontin y Sean Carroll.  9th edición. 2008
  • Traductor de varios artículos del inglés al castellano de la revista Investigación y Ciencia.

Becas, ayudas y premios

    • 2000: Bolsa de viaje y matrícula para el Advanced Practical Workshop: BiobizTM the Biotechnology Company Start-Up training program. Subvencionado por la Comisión Europea y la OITT de la UAB.
    • 1993-94: Beca MEC/Fulbright. Concedida por la Comissión de intercambio cultural entre España y Estados Unidos.
    • 1994: Premio Extraordinario de Tesis Doctoral. Junta de Govern de la Universitat Autònoma de Barcelona.
    • Numerosas bolsas de viajes para conferencias y asistencia a congresos
    • Ayudas para financiar publicaciones resultados de la investigación, Convocatoria de publicaciones de resultados de investigación 1999. Vicerectorat d'Investigació de la UAB. 
    • 1990: Ayuda para proyectos de investigación de investigadores jóvenes. Concedida por la CIRIT, Generalitat de Catalunya
    • 1989: Ayuda para proyectos de investigación de investigadores jóvenes. Concedida por la CIRIT, Generalitat de Catalunya      


Conferencias Conferences

Conferencias invitadas en distintos foros o seleccionadas en congresos científicos

  • 1990: Patrón y probabilidad de apareamiento en una población natural de Drosophila buzzatii. Comunicación oral. XXV Jornadas de Genética Luso-Españolas. Universidad de Alcalá de Henares, Alcalá de Henares. 

  • 1992: Modelo estadístico y pruebas de hipótesis sobre un polimorfismo genético en dos muestras de una población base y otra apareada. Comunicación oral. XXVII Jornadas de Genética Luso-Españolas. Universidad de Badajoz, Badajoz. 

  • 1993: Mating pattern and fitness component analysis associated with inversion polymorphism in a natural population of Drosophila buzzatii. Comunicación oral. Join meeting of the American Society of Naturalists, the Society of Systematic Biologists and the Society for the Study of Evolution. Snowbird, Utah, USA. 

  • 1994: The distribution of electroforetic classes: What are really telling us? Research meeting conference. Museum of Comparative Zoology, Harvard University.

  • 1994: ¿Qué podemos inferir de las clases electroforéticas? Conferencia invitada. Dpto. de Biología, Universidad de Puerto Rico, Río Piedras, Puerto Rico.

  • 1994: El Teorema Fundamental de la Selección Natural: una reinterpretación. Conferencia invitada. Dpto. de Biología, Universidad de Puerto Rico, Río Piedras, Puerto Rico.

  • 1994: ¿Qué nos dice la variación electroforética de la variación proteica? Comunicación oral. XXIX Jornadas de Genética Luso-Españolas. Lérida. 

  • 1996: La detección y medida de la selección natural. Conferencia invitada. Museu de Zoologia, Barcelona.

  • 1997: Recombinación en el nivel del DNA: conversión génica vs entrecruzamiento. Comunicación oral. XI Seminario de Genética de Poblaciones y Evolución. Santiago de Compostela.  

  • 1998: El drama de Burguess Shale. Conferencia invitada. Grup Adenc, 24 nov. Sabadell.

  • 1998: Gene conversion is a major determinant of genetic diversity at the DNA level. Conferencia invitada. Departament of Ecology and Evolution. University of Chicago.

  • 1998: La cuestión sociobiológica. Conferencia invitada. Grupo Adenc, Sabadell, 10 diciembre. Barcelona.

  • 1999: La biodiversidad a la luz de la evolución. Conferencia de clausura. I Curs Internacional de verano del Medio Ambiente, 16 julio Andorra.

  • 1999: Recombination rate predicts inversion size in Diptera. Comunicación oral. VII Congress of the European Society for Evolutionary Biology.  Campus UAB, Cerdanyola (Barcelona), 23-28 agosto 1999. 

  • 1999: El Universo Darwiniano: me replico luego existo. Conferencia invitada. Grup d'Evolució Humana, UAB, Barcelona.

  • 2000: La selección natural del altruismo. Conferencia invitada en la jornada La selección natural a debate. Museu de la Ciència, Barcelona.

  • 2000: La genética del siglo XXI: el mundo feliz. Conferencia/debate. I Congreso Internacional del Medio Ambiente de Andorra, 12 julio. Andorra.

  • 2000: Docencia y futuro de la bioinformática. Comunicación oral. I Jornada de Bioinformática. 16 junio. Cartagena.

  • 2000: Portal de análisis de polimorfismos nucleotídicos. Comunicación oral. XIII seminario de genética de poblaciones y evolución. Baiona (Pontevedra). 8-11 de noviembre 2000. 

  • 2000: La revolución del genoma. Conferencia inaugural. Jornada Perspectivas sobre el Genoma. Sala d'Actes Facultat de Ciències. UAB, 21 noviembre, Barcelona.

  • 2000: La nueva biología en la red. Conferencia invitada. Fira del Futur. Callús, noviembre, Barcelona. 

  • 2001: Bioinformática: la nueva biología en la red. Conferencia invitada. Grup de Evolució Humana, UAB, Barcelona.

  • 2001: Evolución molecular: Interpretando las huellas moleculares. Conferencia de clausura. Seminari Conjunt de les Seccions de Biologia Molecular i Biologia del desenvolupament de la Societat Catalana de Biologia, Canet de Mar, Barcelona.

  • 2001: Evolución molecular: Interpretando las huellas moleculares. Conferencia invitada. Xarxa de Genòmica i Proteòmica. 19 julio, Facultat Ciències UAB.

  • 2001: Enseñando la revolución bioinformática con el ejemplo. Ponencia invitada. Jornada: el uso de herramientas multimedias en la docencia de la facultad: un apuesta de futuro. Facultad de Ciencias. UAB, 18 septiembre, Barcelona.

  • 2001: On SNPs and related concepts. Conferencia seleccionada. 4th International Meeting on Single Nucleotide Polymorphisms and complex genome analysis. Wenner-Gren Center, Estocolmo, Suecia.

  • 2001: Evolución del Genoma. Conferencia invitada. Programa de Actividades Culturales. Facultat de Ciències, Universidad de Girona.

  • 2002: La perspectiva evolutiva de la vida: entre la cooperación y la competencia. Ciclo de conferencias: PARLEM DE  CIÈNCIA I SOCIETAT. Una mirada científica i social sobre alguns temes d'actualitat.  ICE-UAB, Hospital de Sant Pau, Barcelona. 13 de febrero.

  • 2002: Bioinformática, la investigación biomédica in silico. iSOCO headquarters, Intelligent Software, Sant Cugat, Barcelona. 15 de febrero.

  • 2002: Experiencia en la creación de una spin-off. PROJECTE GÈNESI, Fundació Empresa i Ciència. Institut de Biotecnologia i Biomedicina "Vicent Villar Palasí", UAB, Barcelona. 19 de marzo.

  • 2002: Bioinformática, la retos del tratamiento inteligente de información masiva. AdvanCell, in vitro cell technologies. Parc Científic de Barcelona. 16 de abril.

  • 2002: e-Biointel, la experiencia de creación de una spin-off en Bioinformática. Dia de l'emprenedor, BarcelonaActiva, Palacio de Congresos de Cataluña, 24 de abril.

  • 2002: Desvelando la historia de la vida registrada en los genomas. <a href="http://noticias.universia.es/ciencia-nn-tt/noticia/2002/05/02/635519/antonio-barbadilla-ciclo-conferen